为谋求两县省之间的友好关系的发展，1982年在长崎市签订友好协议。
每年一次，在长崎县与福建省之间交替举行，会上确定每年的合作项目，接受技术研修生、贸易研修生，派遣技术专家计划。举办福建省土特产展示会，举办长崎县物产展示会，开设厦门－福州－上海－长崎定期集装箱货运航班（现休航中）等计划。其中有些合作项目取得了很大的成功。
负责部门：长崎县产业政策课、福建省对外经济贸易委员会。
以促进水产科学技术交流为目的。互派水产科学技术视察团，接受研修生，交换科研信息及标本等。
负责部门：长崎县综合水产试验场、福建省水产研究所。
以促进农业、畜牧业、林业领域学术交流为目的。互派视察团，接收研修生，交换种苗、标本、技术文献、技术信息等。
负责部门：长崎县综合农林试验场、福建省农业科学院、林业科学研究所。
以促进本县的国际化为目标，培养具有国际观的人才。派遣县厅职员在福建省的某大学进行一年的语言学研修及中国国情的研究。
负责部门：长崎县总务部人事课、福建省外事办公室
派遣县内的具有一定技术和知识的退休人员─银色人才进行技术指导。
负责部门：长崎县国际课、福建省外事办公室。
作为长久的海外援助项目，长崎县一直在接受友好关系密切的国家派来的研修生。
负责部门：长崎县国际课、福建省外事办公室。
1992年缔结友好协议以来，教授之间共同进行学术交流，项目研究。同时学生之间也进行友好交流。
大学
长崎大学─福州大学
1992年签订学术交流协议
长崎威士来大学─华侨大学
1985年签订学术交流协议
长崎大学医学部─福建医科大学
1997年签订学术交流协议
高级中学
谏早农业高级中学─漳州农业学校
1992年
长崎女子商业高级中学─福州第三中学
1983年
镇西学院高级中学─泉州第五中学
1985年
初级中学
谏早市立明峰中学─漳州市第一中学
1992年
小学
谏早市立御馆小学─漳州市实验小学
1992年
其他
长崎县健康长寿大学─福建省老年大学，厦门老年大学
1999年3月
| 1980年（昭和55年） | 长崎市与福州市签定缔结友好城市协议。 |
| 1982年（昭和57年） | 长崎县与福建省签定缔结友好县省协议。 |
| 1983年（昭和58年） | 佐世保市与厦门市签定缔结友好城市协议，福建省代表团访问长崎。 |
| 1984年（昭和59年） | ◎长崎县县议会、市、村、町议会代表团访问中国。 ◎福建省友好代表团访问长崎。 ◎长崎县经济交流促进团访问中国。（此后，每年组团访问） |
| 1985年（昭和60年） | 福建省在长崎举办土特产品展示会。 |
| 1986年（昭和61年） | 长崎县中国亲善团访问中国。 |
| 1987年（昭和62年） | ◎长崎县知事高田勇率纪念长崎福建缔结友好5周年经济交流促进团访问中国。 ◎在福建举办长崎产业展示会。 ◎举办纪念长崎福建友好缔结5周年专题讨论。 ◎第一届长崎青少年亲善团访问中国。（此后，每年组团访问） |
| 1988年（昭和63年） | ◎举办长崎、福建经济交流处促进会。（此后，每年举办） ◎福建省副省长蔡宁林一行访问长崎。 |
| 1989年（平成元年） | ◎长崎放送（NBC）与福建电视台缔结友好合作关系。 ◎唐船“飞帆”号从中国的福建省来到长崎，进入长崎港。 ◎福建省友好代表团访问长崎。 ◎长崎县日中友好亲善团访问中国，参加在福建省举行友好关系缔结10周年音乐会。 |
| 1990年（平成2年） | ◎福建省综合艺术团在长崎“旅”博览会演出。 ◎福建省省长王兆国率团访问长崎。 ◎福建省泉州木偶剧团在长崎“旅”博览会演出。 |
| 1991年（平成3年） | ◎谏早市与漳州市签订缔结友好城市协议。 ◎福建省省长贾庆林率团访问长崎。 |
| 1993年（平成5年） | ◎福建省人民代表大会常务委员会主任陈光毅率团访问长崎。 ◎福建省省长陈明义率团访问长崎。 ◎福建省政治协商会议主席游德謦率团访问长崎。 |
| 1995年（平成7年） | ◎平户市与南安市签订缔结友好城市协议。 ◎长崎县知事高田勇率长崎中国总领事馆开馆10周年纪念团访问中国。 ◎福建省人民代表大会常务委员会副主任袁启率团访问长崎。 |
| 1996年（平成8年） | ◎平户市与南安市签订缔结友好城市协议。 ◎福建省副省长张家堪率团访问长崎。 |
| 1997年（平成9年） | ◎长崎县知事高田勇率友好亲善团访问中国。 ◎北有马町与福州市的罗源县签订缔结友好城市协议。 |
| 1998年（平成10年） | 福建省副省长潘心城率团访问长崎。 |
| 1999年（平成11年） | 长崎县知事金子原二郎率代表团来上海参加长崎与上海之间的定期空运航班的通航20周年庆祝活动，参加中华人民共和国建国50周年纪念活动，金子知事会见福建省委书记陈明义，福建省代省长习近平。 |
| 2000年（平成12年） | 福建省副省长贾锡太率团访问长崎。 |
| 2002年（平成14年） | ◎长崎县知事金子原二郎率长崎县福建省缔结友好关系20周年亲善团访问中国。 ◎金子知事会见福建省委书记宋德福、厦门市市长张昌平。 ◎长崎县町村议长会代表团访问福建省。 ◎长崎县日中友好亲善团访问中国，参加在福建省举行友好关系缔结10周年音乐会。 |
| 2004年（平成16年） | 副知事等6人参加“福建省国际友好大会”。 |
| 2007年（平成19年） | ◎为纪念长崎县福建省友好城市缔结25周年记念暨日中恢复邦交正常化35周年，长崎县知事率访华团访问福建省。 ◎长崎县政府、县议会、经济团体、各市町等组成的访华团一行与福建省人民政府黄小晶省长举行会见。 |
| 2008年（平成20年） | 福建省海洋渔业考察团访问长崎（张昌平常务副省长）。 |
| 2009年（平成21年） | ◎苏增添福建省副省长一行访问长崎。 ◎刘文豪福建省人民代表大会常务委员会委员一行访问长崎。 |
| 2010年（平成22年） | ◎苏增添福建省副省长兼福州市长一行访问长崎。 ◎中华人民共和国福建省等长崎县访问团。 |
| 2011年（平成23年） | 宋克宁福建省外事办公室主任一行访问长崎。 |
| 2012年（平成24年） | 长崎县・福建省友好省县缔结30周年纪念福建省代表团访问长崎 （倪岳峰副省长） |
| 2016年（平成28年） | 张昌平中国人民政治协商会议福建省委员会主席一行访问长崎。 |
| 2017年（平成29年） | ◎长崎县・福建省友好省县缔结35周年 中日邦交正常化45周年纪念访问团。 ◎长崎县・福建省友好省县缔结35周年 中日邦交正常化45周年纪念访问团访问长崎（李德金副省长）。 |
| 2018年（平成30年） | ◎福建省赠与石狮像揭幕仪式。 ◎胡昌升中国共产党福建省委员会常务委员、组织部部长一行访问长崎。 |
| 2019年（令和1年） | 福建省于伟国书记访问长崎 |
